La tercera división, creada en 1929, a sufrido múltiples variaciones a lo largo de su historia. Inicialmente se trataba de una categoría con 33 equipos divididos en 8 grupos, siendo los equipos navarros junto a vascos, riojanos, aragoneses, cantabros y algunos castellano-leoneses, los que formaría el Grupo II de esta división. Tras la Guerra Civil este sistema seria suprimido, siendo reemplazado por la Primera Regional, aunque finalmente seria restaurada en el año 1944.

Después de casi 40 años funcionando de esta forma en la temporada 1980/81 la categoría seria modificada creando nuevos grupos y distribuyendo a los equipos de forma autonómica. 

El Grupo II del anterior sistema pasaría a ser el Grupo IV formado por Navarra, La Rioja y Soria, el cual no duraría mas de 5 años, siendo modificado en la temporada 1986/87  separando a los equipos sorianos.

Fue en la temporada 2006/07 cuando los equipos riojanos y navarros serian divididos en los grupos XVI (La Rioja) y XV (Navarra).